No son las mas usadas durante la identificacion de la planta, porque no estan visibles, pero la importancia para distinguir entre varios tipos de plantas herbaceas ha sido notada.Existen varios tipos distintos de partes subterraneas.
Las raices anclan la planta al suelo y absorben agua y minerales. Generalmente crecen hacia abajo o hacia afuera.Nunca son verdes y nunca tienen hojas o brotes.
La primera raiz de la germinacion, puede persistir, creciendo en longitud y espesor, ramificandose formando una raiz principal (como en la mayoria de las dicotiledoneas) o la raiz primaria puede no persistir, ya que su funcion ha sido tomada por raices producidas a partir de brotes en la base de los tallos (raices adventicias), formando un sistema radicular fibroso (como en la mayoria de las monocotiledoneas).
Algunas plantas tener raÃces que se hinchan y actuan como órganos de almacenamiento de alimentos (por ejemplo, la zanahoria); tales órganos son conocidos como tubérculos.